El recorrido se encuentra dividido en cuatro secciones principalmente:

Primera Sección: Entrada al recinto con un área de 114 m2 , donde se encuentra ubicada la taquilla, una tienda de souveniers de artículos alusivos al mar y dos baños múltiples para el servicio al público

Segunda Sección: Ocupa un area de 330 m2 y consta de 25 acuarios en donde se representan los diferentes ambientes marinos.

Cuenta también con una pileta de contacto donde se tienen organismos que pueden ser manipulados ya que su fisiología permite su extracción parcial del medio acuático; además, puede ser utilizado como una estrategia de sensibilización que facilite el aprendizaje y conscientice a los diferentes visitantes especialmente a los menores de edad.

Adjunto a la salida de esta sección, se encuentra la coleccion de conchas t algunas estructuras oseas de peces.

Tercera sección: Esta formada por un túnel corredor donde los visitantes tienen acceso visual por debajo del nivel del agua de dos piscinas: un Mega-Acuario donde estan los tiburones gato, tortugas marinas, grandes jureles y sabalos; y el acuario Arrecifal donde podran conocer algunos de los peces arrecifales entre ellos Ramon nuestro pez globo.

Cuarta sección: En el patio exterior se encuentra un muro rodeado de jardines donde se encuentran el tortugario, el rayario y el biotario de tortugas de agua dulce. Tambien se exhibe una especie de mangle, el mangle rojo, Rizophora mangle.

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